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简要描述:染色质免疫沉淀(CHIP)是一种用于表观遗传学研究的技术,可以快速反映蛋白质-DNA相互作用。

  • 更新时间:2024-09-14
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染色质免疫沉淀(CHIP)是一种用于表观遗传学研究的技术,可以快速反映蛋白质-DNA相互作用。

概念:染色质免疫沉淀法(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是一种基于抗原抗体反应的特异性,从而起到选择性地使DNA结合蛋白及其DNA靶标富集的作用,是在全基因组水平研究生命体组织或细胞内蛋白质与DNA相互作用的一种技术方法。

实验原理

首先在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后利用抗原抗体反应的特异性,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片段的纯化与检测分析,获得蛋白质与DNA相互作用的信息,可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。ChIP可用来研究某种特殊的蛋白-DNA相互作用、多种蛋白-DNA相互作用或全基因组或部分基因内的相互作用。

实验步骤

细胞固定

甲醛交联

染色质断裂

超声

免疫沉淀蛋白

和DNA复合物

用Protein-A/G Sephrose回收免疫沉淀

沉淀收集,洗涤,

解交联

蛋白酶K/NaCl处理,接触交联

DNA纯化

鉴定

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