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CHIP
染色质免疫沉淀(CHIP)是一种用于表观遗传学研究的技术,可以快速反映蛋白质-DNA相互作用。
概念:染色质免疫沉淀法(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是一种基于抗原抗体反应的特异性,从而起到选择性地使DNA结合蛋白及其DNA靶标富集的作用,是在全基因组水平研究生命体组织或细胞内蛋白质与DNA相互作用的一种技术方法。
实验原理
首先在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后利用抗原抗体反应的特异性,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片段的纯化与检测分析,获得蛋白质与DNA相互作用的信息,可以真实地反映体内蛋白因子与基因组DNA结合的状况。ChIP可用来研究某种特殊的蛋白-DNA相互作用、多种蛋白-DNA相互作用或全基因组或部分基因内的相互作用。
实验步骤
细胞固定
甲醛交联
染色质断裂
超声
免疫沉淀蛋白
和DNA复合物
用Protein-A/G Sephrose回收免疫沉淀
沉淀收集,洗涤,
解交联
蛋白酶K/NaCl处理,接触交联
DNA纯化
鉴定
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